企业整体拆迁是指政府为了城市规划、重建或进步需要，将企业的厂房、土地等资产强制性征收并进行拆除的过程。在整体拆迁过程中，政府部门需要对企业进行适当的赔偿，以确保企业的利益不受损害。下面是一些赔偿方法：

1. 土地补偿：政府依据土地的实质价值对企业进行补偿，补偿的金额应该是公平适当的。

2. 建筑物补偿：政府应该对企业的建筑物进行评估，并依据其价值进行合理补偿。这个补偿应包含建筑物的市场价值与拆除、重建的成本。

3. 移动补偿：假如企业需要迁至新的地址，政府应该对企业的搬迁成本进行补偿，包含设施的搬迁、办公设施的购置等等。

4. 经营损失补偿：政府应该对企业因拆迁而产生的经营损失进行补偿。这个补偿应依据企业的经营状况、预计收入、适应新的经营环境所需的改变等原因进行合理计算。

5. 职员安置补偿：在整体拆迁过程中，企业的职员也应该得到妥善安置和补偿。政府可以提供就业援助、转岗培训等服务，以帮助职员重新就业。

6. 其他成本补偿：政府还应该对企业因拆迁而产生的其他成本进行补偿，如法律咨询成本等。

需要强调的是，政府在整体拆迁过程中应该严格根据法律法规的需要进行赔偿，确保公平、公正、合理。假如企业觉得赔偿金额不合理，可以通过法律方法进行申诉和维权。总之，企业在整体拆迁中的赔偿主要包含土地补偿、建筑物补偿、移动补偿、经营损失补偿、职员安置补偿和其他成本补偿等多个方面，通过适当的赔偿，可以保障企业的利益不遭到损害。